例えばIE６だけに補正するCSSを読ませたい場合は、Drupalのテーマの.infoファイルに以下のように書くと
conditional-stylesheets[if lte IE 6][all][] = ie.css
自動で以下のように条件付きでスタイルシートを読み込むタグが出力されます。
<!--[if lte IE 6]>
<link rel="stylesheet" href="/sites/all/themes/zen/ie6-fixes.css" type="text/css" />
<![endif]--># 他のテーマでは試してないのでZENテーマだけかもしれないけどね
